Susunan dan kedudukan bendera adalah bergantung kepada di mana bendera-bendera tersebut hendak dikibarkan atau dihamparkan. Susunan yang biasa dibuat ialah:

(1) Susunan Bendera Di Luar Dan Di Dalam Bangunan

(a) Susunan Pada Hari Biasa Dan Hari-Hari Kebesaran Persekutuan Jika hanya dua bendera dikibarkan di majlis peringkat Persekutuan yang diadakan dalam negeri maka susunannya ialah seperti berikut:-

Jika tiga bendera dikibarkan di majlis peringkat Persekutuan yang diadakan dalam negeri, maka susunannya ialah seperti berikut:

(b) Susunan Pada Hari-Hari Kebesaran Negeri Jika hanya dua bendera dikibarkan pada majlis peringkat negeri di negeri yang berkenaan maka susunannya adalah seperti berikut:

Jika tiga bendera dikibarkan di majlis peringkat negeri, maka susunannya ialah seperti berikut:

(c) Susunan Apabila Mengibarkan Bendera Persekutuan Dengan Negeri-Negeri Bendera-bendera yang dikibarkan cara sebaris dan keutamaannya bermula dari kiri ke kanan ditunjukkan seperti berikut:

Bendera-bendera yang dikibarkan cara dibahagi dua belah dan keutamaannya bermula dari dalam ditunjukkan seperti berikut:

(d) Susunan Di Persidangan Antarabangsa

Di persidangan antarabangsa bendera-bendera hendaklah dikibarkan atau disusun mengikut dua cara berdasarkan susunan abjad nama negara-negara berkenaan dan seperti yang telah ditetapkan oleh pertubuhan berkenaan jika ada.

(e) Susunan Di Gedung/Kedai/Rumah Bila bendera Malaysia dipasangkan rumah, maka ia hendaklah dikibarkan pada tiang yang dicondongkan ke arah jalanraya. Di deretan gudang/kedai pula, jika dua bendera dipasangkan di dalam Wilayah Persekutuan maka bendera Malaysia mestilah dikibarkan di sebelah kiri dan bendera yang lagi satu sebelah kanan pada tiang yang dicondongkan ke arah jalanraya.

(f) Susunan Dalam Keadaan Bersilang Dalam keadaan bendera Malaysia diletakkan bersilang, bendera Malaysia hendaklah diletakkan di sebelah kiri dan di atas bendera yang lain.

Jika bendera Malysia diletakkan di dalam satu kumpulan bendera negeri dan bendera Swasta, bendera Malaysia hendaklah dikibarkan di tengah-tengah di antara dua bendera dan tiangnya diletakkan terkeatas dari bendera yang lain. Bendera negeri diletakkan di sebelah kiri manakala bendera swasta di sebelah kenan.

(g) Susunan Semasa Lawatan Negera/Rasmi Adalah menjadi amalan biasa negara kita memberi kehormatan (courtesy) kepada palawat itu, maka bendera pelawat diberi keutamaan atas bendera Malaysia. Misalnya semasa lawatan Paduka Yang Mulia Presiden Indonesia, susunan benderanya adalah seperti rajah di bawah.

(h) Susunan Bendera Khusus Bagi Acara Dalam Dewan / Benguan / Stadium

(2) Susunan Bendera Dalam Perarakan

(a) Bendera Berkibar Jika bendera diarak secara sebaris, bendera Malaysia hendaklah mendahului bendera-bendera lain.

(b) Bendera Terbentang Jika bendera dibawa berarak secara terbentang, bahagian kepala bendera hendaklah diusung mendahului perarakan sama seperti jika ianya dibawa dengan tiang bendera.

(3) Susunan dan kedudukan pada dinding/tembak bangunan atau objek yang statik

     Apabila bendera Malaysia dipamerkan atau dilukis pada dinding, tembok bangunan atau objek yang statik. Bahagian Bulan Bintang atau kepala bendera hendaklah terletak di sebelah kiri, dipandang dari hadapan.

     Apabila bendera Malaysia dibentangkan di belakang tempat berucap, ia mestilah dibentangkan terkeatas dan di belakang orang yang berucap.

     Apabila dua atau lebih bendera dipamerkan di dinding, keutamaan hendaklah diberikan kepada bendera Malaysia. Susunannya sama seperti susunan mengibarkan bendera Malaysia dan megeri-negeri. Di Majlis-majlis sempena lawatan negara/rasmi jika bendera negara pelawat dan bendera Malaysia dipamerkan, kedudukan bendera negara palawat ialah di sebelah kiri, dipandang dari hadapan.

     Apabila bendera Malaysia dibentangkan di belakang tempat berucap, ia mestilah dibentangkan terkeatas dan di belakang orang yang berucap.

     Apabila dua atau lebih bendera dipamerkan di dinding, keutamaan hendaklah diberikan kepada bendera Malaysia. Susunannya sama seperti susunan mengibarkan bendera Malaysia dan negeri-negeri. Di Majlis-majlis sempena lawatan negara/rasmi jika bendera negara pelawat dan bendera Malaysia dipamerkan, kedudukan bendera negara pelawat ialah di sebelah kiri dan bendera Malaysia di sebelah kanan dipandang dari hadapan.